Das Museum, eingebettet in ein historisches und ökologisches Umfeld von höchster Qualität, soll die Erinnerung an den Aufenthalt Napoleon Bonapartes auf der Insel bewahren, der nach seiner Abdankung und dem Vertrag von Fontainebleau ins Exil auf Elba gezwungen wurde. Heute werden dort Reliquien, Einrichtungsgegenstände und Möbel aus dieser Zeit sowie ein Teil der interessanten Bibliothek aufbewahrt, die der Kaiser mitbrachte und später der Gemeinde Portoferraio schenkte.