Le musée, situé dans un contexte historique et environnemental de grande qualité, vise à préserver la mémoire du séjour sur l'île de Napoléon Bonaparte, contraint à l'exil sur l'île d'Elbe après son abdication et le traité de Fontainebleau. Aujourd'hui, on y conserve des reliques, des meubles et des objets d'époque, ainsi qu'une partie de l'intéressante bibliothèque que l'empereur avait apportée avec lui et qu'il a ensuite offerte à la communauté de Portoferraio.