Il Museo è stato realizzato all’interno dell’ex Direzione del Carcere dell’isola. Contiene reperti geologici e archeologici, tornati definitivamente sull’isola, arricchendone la memoria naturalistica e storica. Qui è raccontata l’evoluzione paleogeografia dell’isola e sono esposti minerali e reperti provenienti dai siti archeologici e dai relitti marini. Il Museo contiene anche un laboratorio, un’aula di microscopia, una per conferenze e una biblioteca.